Scores de risque polygénique (tests PRS)

Les scores PRS sont destinés à fournir une évaluation quantitative du risque futur de maladie d’un individu en fonction de ses gènes, afin d’aider les professionnels de la santé à fournir les meilleurs conseils sur le mode de vie. Ils ne sont pas destinés au diagnostic d’une maladie ou d’un état de santé.

Vous devriez choisir ce test si vous êtes en bonne santé et souhaitez évaluer votre risque génétique de futures maladies chroniques et recevoir des conseils personnalisés pour atténuer ce risque en modifiant votre mode de vie.

Ce test ne doit être effectué que sur des adultes consentants et n’est pas destiné à être utilisé, et n’a aucune utilité, pour évaluer le risque dans l’une des situations suivantes : enfants de moins de 18 ans ; fécondation in vitro-sélection d’embryons ; dépistage des porteurs pour planification familiale.

1. Les sections « Résultats et interprétation » contiendront votre score de risque polygénique sous forme de résultat numérique, ainsi que sa traduction en risque relatif, par ex. « Votre risque de développer un cancer sur 10 ans est 1,9 fois supérieur à celui de la population générale »
2. La section « Recommandations » contiendra des conseils de style de vie sur mesure, basés sur les facteurs de style de vie du questionnaire et le résultat du PRS.

Le score de risque polygénique est exprimé en écarts types par rapport au PRS moyen (score z), donc une valeur PRS de 1,3 signifie que le PRS de l’individu est supérieur de 1,3 écart type à celui d’une personne moyenne, qui obtiendrait un score PRS de 0. Les calculs de risque sont basés sur une estimation du rapport de risque par écart type (HRsd) dérivée d’un modèle de risques proportionnels de Cox estimé à partir des données de la biobanque internationale.

Pour arriver au risque relatif de changement de facteur (c’est-à-dire le risque X risque dans la population générale), nous calculons d’abord le risque absolu pour le patient et une personne avec un PRS moyen du même âge et de la même nationalité. Ce calcul intègre des informations contextuelles spécifiques au pays – la mortalité toutes causes confondues par âge (c’est-à-dire les décès par toute autre cause que la maladie), l’incidence de la maladie et la mortalité due à la maladie. Ces risques sont intégrés sur un horizon temporel de 10 ans dans des estimations de risque absolu sur 10 ans à l’aide des méthodes d’analyse de survie. Pour plus d’informations à ce sujet, voir Choudhury et al. (Pal Choudhury P, Maas P, Wilcox A, Wheeler W, Brook M, Check D, et al. PloS one. 2020 ;15(2):e0228198). Enfin, le rapport entre ces deux risques absolus (risque pour le patient/risque pour une personne moyenne de même âge et de même nationalité) est donné en terme de risque relatif.

Les scores PRS ne sont pas destinés au diagnostic d’une maladie ou d’un état de santé. Un risque élevé estimé par le PRS ne signifie pas que l’individu développera la maladie au cours de sa vie, et un score de risque modéré ou faible ne signifie pas que l’individu ne développera pas la maladie. Selon la condition, les analyses PRS prennent en compte une gamme de dizaines à des millions de variantes génétiques communes qui ont été solidement associées à la maladie en question. Cependant, il peut également y avoir d’autres variantes génétiques, non encore identifiées, impliquées dans le risque génétique. De plus, ce test ne prend pas en compte les variants pathogènes connus ou inconnus dans les gènes connus de susceptibilité aux maladies. Ceux-ci peuvent être présents mais non identifiés et peuvent en outre contribuer au risque génétique d’un individu de développer une maladie.